Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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