Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Tmod3Q9JHJ0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Tmod3Q9JHJ0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Tmod3Q9JHJ0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Tmod3Q9JHJ0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tmod3Q9JHJ0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tmod3Q9JHJ0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tmod3Q9JHJ0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tmod3Q9JHJ0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tmod3Q9JHJ0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tmod3Q9JHJ0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod3Q9JHJ0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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