Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Pgpep1Q9ESW8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Pgpep1Q9ESW8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Pgpep1Q9ESW8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Pgpep1Q9ESW8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Pgpep1Q9ESW8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Pgpep1Q9ESW8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Pgpep1Q9ESW8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Pgpep1Q9ESW8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Pgpep1Q9ESW8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Pgpep1Q9ESW8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Pgpep1Q9ESW8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pgpep1Q9ESW8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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