Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc4Q9ES56 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms