Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 608 ms