Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms