Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms