Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem43Q9DBS1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms