Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms