Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph3bQ9DA80 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms