Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms