Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9G3

Chic2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic2Q9D9G3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Chic2Q9D9G3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chic2Q9D9G3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chic2Q9D9G3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chic2Q9D9G3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chic2Q9D9G3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chic2Q9D9G3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chic2Q9D9G3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms