Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmco5aQ9D9D5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms