Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Q9D8L0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D8L0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D8L0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D8L0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D8L0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms