Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms