Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rep15Q9D7T1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rep15Q9D7T1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rep15Q9D7T1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rep15Q9D7T1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rep15Q9D7T1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rep15Q9D7T1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rep15Q9D7T1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rep15Q9D7T1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rep15Q9D7T1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rep15Q9D7T1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rep15Q9D7T1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rep15Q9D7T1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rep15Q9D7T1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rep15Q9D7T1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rep15Q9D7T1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rep15Q9D7T1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rep15Q9D7T1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rep15Q9D7T1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rep15Q9D7T1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rep15Q9D7T1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Rep15Q9D7T1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rep15Q9D7T1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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