Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms