Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.4 ms