Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Clvs1Q9D4C9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clvs1Q9D4C9 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms