Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rufy3Q9D394 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms