Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F8

Toporsl, Topoisomerase I-binding, arginine/serine-rich-like, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporslQ9D2F8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ToporslQ9D2F8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ToporslQ9D2F8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ToporslQ9D2F8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ToporslQ9D2F8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ToporslQ9D2F8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ToporslQ9D2F8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ToporslQ9D2F8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms