Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms