Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Mrpl28Q9D1B9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Mrpl28Q9D1B9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Mrpl28Q9D1B9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Mrpl28Q9D1B9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Mrpl28Q9D1B9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Mrpl28Q9D1B9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mrpl28Q9D1B9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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