Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syf2Q9D198 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms