Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D131 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D131 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D131 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q9D131 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q9D131 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D131 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D131 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D131 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D131 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q9D131 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms