Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Sgo1Q9CXH7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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