Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Khdc3Q9CWU5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Khdc3Q9CWU5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms