Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ddx28Q9CWT6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ddx28Q9CWT6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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