Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NubplQ9CWD8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms