Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccer1Q9CQL2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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