Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole4Q9CQ36 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms