Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnaseh2cQ9CQ18 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms