Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms