Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Nsmce3Q9CPR8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Nsmce3Q9CPR8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Nsmce3Q9CPR8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Nsmce3Q9CPR8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Nsmce3Q9CPR8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Nsmce3Q9CPR8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Nsmce3Q9CPR8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nsmce3Q9CPR8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nsmce3Q9CPR8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nsmce3Q9CPR8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nsmce3Q9CPR8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nsmce3Q9CPR8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nsmce3Q9CPR8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Nsmce3Q9CPR8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nsmce3Q9CPR8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nsmce3Q9CPR8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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