Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn6Q99PL6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms