Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nup155Q99P88 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms