Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rassf3Q99P51 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rassf3Q99P51 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms