Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b1Q99NB9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b1Q99NB9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b1Q99NB9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b1Q99NB9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b1Q99NB9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b1Q99NB9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b1Q99NB9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b1Q99NB9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b1Q99NB9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b1Q99NB9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b1Q99NB9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b1Q99NB9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b1Q99NB9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b1Q99NB9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b1Q99NB9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b1Q99NB9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b1Q99NB9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b1Q99NB9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b1Q99NB9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b1Q99NB9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms