Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp16Q99LG0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp16Q99LG0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms