Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf19Q99KP6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf19Q99KP6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf19Q99KP6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf19Q99KP6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf19Q99KP6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf19Q99KP6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf19Q99KP6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf19Q99KP6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf19Q99KP6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf19Q99KP6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf19Q99KP6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf19Q99KP6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf19Q99KP6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf19Q99KP6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf19Q99KP6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf19Q99KP6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf19Q99KP6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf19Q99KP6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf19Q99KP6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf19Q99KP6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prpf19Q99KP6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms