Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cdk9Q99J95 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdk9Q99J95 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdk9Q99J95 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdk9Q99J95 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdk9Q99J95 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdk9Q99J95 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdk9Q99J95 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdk9Q99J95 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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