Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ddb2Q99J79 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ddb2Q99J79 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ddb2Q99J79 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms