Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms