Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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