Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atl3Q91YH5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms