Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms