Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG6

Traip, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraipQ8VIG6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraipQ8VIG6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms