Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms