Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn4Q8VCH8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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