Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

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Length 1,104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpm8Q8R4D5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trpm8Q8R4D5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm8Q8R4D5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms